President Theodore Roosevelt riep de leiders van de universiteitsatletiek aan twee conferenties van het Witte Huis bijeen om dergelijke hervormingen aan te moedigen. Begin December 1905, riep Kanselier Henry M. MacCracken van de Universiteit van New York een vergadering van 13 instellingen bijeen om veranderingen in de speelregels van de universiteitsvoetbal in werking te stellen. Op een verdere vergadering 28 December in de Stad van New York, werd de Intercollegiate Atletische Vereniging van de Verenigde Staten (IAAUS) opgericht door 62 leden.

IAAUS werd officieel gevormd 31 Maart, 1906, en nam zijn huidige naam (NCAA) in 1910. verscheidene jaren, was NCAA een besprekingsgroep en regel-makend lichaam; maar in 1921, werd het eerste NCAA nationale kampioenschap gehouden: de nationale Collegiale Kampioenschappen van het Spoor en van het Gebied. Geleidelijk aan, werden meer regelscommissies gevormd en meer kampioenschappen werden gehouden.

Een reeks crisissen bracht de voetbal van de Universiteit (NCAA) aan kruispunten na Wereldoorlog II. De „Sanity Code“--goedgekeurd om richtlijnen voor het aanwerven en financiële steun te bepalen--er niet in geslaagd om misbruiken in bedwang te houden die student-atleten impliceren. Postseason voetbalspelen vermenigvuldigden zich snel. Instellingen van het lid waren meer en meer bezorgd over de gevolgen van onbeperkte televisie voor voetbalopkomst.

De ingewikkeldheid en de draagwijdte van deze problemen en de groei in lidmaatschap en kampioenschappen toonden de stijgende behoefte aan full-time professionele leiding aan. In 1951, werd Walter Byers, die eerder als part-time uitvoerende medewerker had gediend, genoemd uitvoerende directeur. Werd het nationale hoofdkwartier opgericht in de Stad van Kansas, Missouri, in 1952. Een programma werd om levende televisie van voetbalspelen te controleren goedgekeurd, werden de jaarlijkse Overeenkomst afgevaardigde handhavingsbevoegdheden aan de de Raad en wetgeving van de Vereniging `s goedgekeurd regerend postseason komspelen.

Het lidmaatschap van de Vereniging werd `s verdeeld in drie wetgevende en concurrerende afdelingen in 1973 bij de eerste speciale ooit gehouden Overeenkomst. Vijf later jaar, stemde Afdeling I leden om onderverdelingen I-a en I-aa in de sport van voetbal tot stand te brengen.

NCAA begon beherend vrouwen`s- atletiekprogramma's in 1980 toen Afdelingen II en III 10 kampioenschappen voor 1981-82 vestigden. Een later jaar, keurde de historische 75ste Overeenkomst een uitgebreid bestuurplan goed om de programma's, de diensten en de vertegenwoordiging van de vrouwen`s atletiek te omvatten. De afgevaardigden breidden het vrouwen`s- kampioenschappenprogramma met de toevoeging van 19 gebeurtenissen uit.

Op 1 Augustus, 1997, voerde NCAA een verandering in zijn bestuurstructuur die uit de grotere autonomie voor elke afdeling en meer controle door de voorzitters van lidhogescholen en universiteiten verstrekt.

Walter Byers trok 1 Oktober, 1987, na 36 jaar als uitvoerende directeur van de Vereniging terug `s. Hij werd vervangen door Richard D. Schultz, die in 1993 aftrad. Vandaag, wordt het nationale bureaupersoneel van meer dan 320 werknemers die in Indianapolis worden gebaseerd geleid door President Cedric W. Dempsey.